La Casa Cotes es regentada por la matrona Rosa Cotes, exgobernadora y ex primera dama del reino del Magdalena. La Casa construyó sus bases económicas sobre el negocio del banano y sus bases políticas de la mano del paramilitarismo. En 2009, José Francisco Zúñiga, esposo de la matrona y exalcalde de Santa Marta, fue condenado por recibir el apoyo de Hernán Giraldo y el Bloque Norte de las Autodefensas para llegar a su cargo. Desde entonces, paramilitares desmovilizados han señalado a Álvaro y Luis Miguel Cotes, hermanos de Rosa, de apoyar y entregar contratos a las Autodefensas Unidas de Colombia.

Con el Grupo Mercantil del Caribe, los Cotes expandieron su riqueza a las tierras de Panamá, a través de la sociedad anónima offshore Instinet América S.A., accionista del Grupo Mercantil. Aunque la colombiana tiene activos por más de $139 millones, en el vecino país, Instinet América fue incluida en la lista de empresas que deben más de 10 años de impuestos al Gobierno panameño.

En el reinado de Rosa Cotes en el Magdalena, documentos de identificación expedidos por la Oficina de Pasaportes terminaron en manos de miembros de Al-Qaeda, capturados en Estados Unidos. Entre los funcionarios de la Oficina en el momento de los hechos, 2016-2018, se encontraba su cuñada y exasesora de imagen, Isabel Cristina Habeych, tía del exgobernador Luis Miguel Cotes Habeych, contratada en 2017 como profesional especializada. Isabel Habeych no fue detenida ni vinculada al proceso.